30 2022．03

【RNAseq分析對決 -- 更多 vs. 多】

|| 差異富集分析GO、DO、KEGG ||

到底是這家的RNAseq服務吸引人，還是那家的RNAseq服務令人嚮往?

本集對決內容 -- 更多 vs. 多

差異富集分析結果可快速幫助我們快速了解 差異基因 與哪些疾病或 代謝路徑 有關，不同組別、上下調、不同資料庫、不同呈現方法，各種排列組合， 可不可以全都要 ？！

▍多還要更多

3種資料庫結果：GO、KEGG、DO
各種富集圖：長條圖、點圖、網絡圖
N種排列組合呈現方式：GO 3大類別分別或同時呈現

多種選擇，總能找到你需要的、老闆想要的！
這家的更多和那家的多，對決結果會是如何？

▍3種資料庫：GO、KEGG、DO

▶▶ 多

提供1-2種資料庫搜尋結果。

▶▶更多

提供3種資料庫結果。

KEGG: KEGG 資料庫整合了基因體、生化、生物系統等資訊
GO: 一次把基因功能分類彙整，你可以使用GO資料庫! 將基因屬性分為三大類： Biological Process、Cellular Component、Molecular Function。
DO: 提供生物醫學中人類疾病的標準分類，可在此資料庫中了解基因與疾病間的關係。DO支援了：DO、 DisGeNET、NCG 常見資料庫資料。

▶ 了解更多關於3種資料庫的說明

▍KEGG有更多的呈現方式？

▶▶ 多

提供基因對應Pathway結果與KEGG Pathview圖。

▶▶更多

圖爾思提供除了 KEGG pathway 對應結果外，也針對 KEGG 依單元代謝功能整理的模組 (Module) 進行富集分析，提供更多的呈現方式，像是：barplot、dotplot、KEGG pathview。可藉由其他呈現圖來快速了解這些基因分配到的pathway重要性為何？

▍GO的呈現方式其實還有其他組合？

▶▶ 多

提供 MF/BP/CC三大類別分開的： barplot 、dotplot、Enrichment Map、Gene Concept Network、有向非循環圖。

▶▶更多

圖爾思提供 MF/BP/CC的：barplot (三大類別分開 & 整體的結果)、dotplot、Enrichment Map、Gene Concept Network、有向非循環圖、Upset plot。Barplot除了提供三大類別整體富集的結果外，還有提供正負調控的長條圖喔！

多種數據呈現的方式，都是為了幫助科學家找到最適合自己解釋的方法！
圖爾思RNAseq分析，真的”五“料！給你MORE, MORE, MORE !

下集 進水救火 vs. 遠水救火 ，RNAseq分析對決，下次見!

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2022．03．30