BIOTOOLS檔案_三代定序雙平台，圖爾思給您最佳解

在進行基因體的研究，三代定序的長讀長是序列組裝的最佳利器，PacBio 與 ONT 兩大定序平台，已經受到各項基因體計畫肯定，但是，您是否猶豫過：
究竟哪個三代定序平台，最適合我的基因體研究呢？

本次案件分享的客戶，主要進行人類病毒的研究，客戶曾經委託其他廠商針對病毒分離株，進行 PacBio 的全基因體解序，但是取得的組裝報告，不僅組裝基因體大小不符預期，同時缺少多個重要基因的序列，這讓後續的基因體研究窒礙難行。客戶針對相同樣本，挑選重要區域進行 Sanger 定序，發現 缺失序列具有高 GC% 的特性，將驗證結果詢問該廠商，卻未能取得滿意答覆。

該客戶聽說圖爾思擁有 PacBio 與 ONT 三代定序雙平台，因此尋求圖爾思的協助，希望能了解之前遇到困難的可能原因，更重要的是，希望能提供病毒全基因體完整組裝的解決方案。

 在圖爾思三代領域應用科學家 (Field Application Scientist, FAS) 與客戶了解上次定序的前因後果，雖然無法知道其他廠商實驗和分析詳細的資訊，但根據對於 PacBio 定序平台的瞭解， 從偵測訊號的原理、建庫流程的步驟，以及分析參數差異等等原因，和客戶說明無法取得完整組裝基因體的可能原因。並且也向客戶介紹 ONT 定序的原理，是偵測 DNA 序列通過奈米孔蛋白造成的離子流阻力的變化，定序過程不受到 DNA 聚合酶工作效率的影響，在基因體不同 GC 比例區域，能取得更均勻的定序結果。ONT 的超長讀序，還能取得超越 HiFi reads 讀長的序列 (一般 HiFi reads 長度是 2-20 kb)，單一序列即可讀穿傳統困難定序區域。藉由 FAS 的詳細說明，客戶也加深了對 ONT 平台的信心，因此決定委託圖爾思利用 ONT 平台進行病毒基因體的定序。

為了能取得最佳的數據進行組裝，也和客戶確認樣品製備使用的 protocol，仔細判讀樣品 QC 結果給予建議的純化方案，確保樣品經過純化後，在純度與完整度皆符合 ONT 上機要求。數據 QC 顯示有多條序列長度超過 100kb，甚至有單一序列達到基因體覆蓋率 > 99% 的情況，顯示純化策略的成功，和善用 ONT 超長讀長的優點。

最終的基因體組裝分析，在查閱同類型樣品的文獻，與生資人員討論最適合的組裝參數，並判斷分析結果的合理性，確保分析報告能確切符合客戶需求，後續客戶也很高興能取得完整的組裝基因體資訊。

本次分享的案件，處處能感受圖爾思三代定序 FAS 的專業陪伴，不僅在售前諮詢讓客戶清楚明白遭遇困難的原因，並且精準判斷三代定序平台優勢，提供客戶有效的解決方案，在後續的案件執行中，每個階段都能感受到認真對待客戶樣品，與嚴格把關每份報告的精神，圖爾思三代定序，用心對待您與您的樣品。

若您有遇到相同的問題，歡迎與我們聯繫。 

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