單一蛋白質序列/分子量鑑定

單一蛋白質序列/分子量鑑定

蛋白質序列鑑定的服務可以有效地解析蛋白質的氨基酸組成,由於質譜儀的靈敏度與效率不斷改良,可以有別於Edman sequence的化學定序法,提供客戶一種更有效率更經濟實惠的定序方式。

服務內容

定序的原理和蛋白質ID相同,利用蛋白酶將樣本中的蛋白水解成小片段的胜肽段後,通過質譜儀分析每一段胜肽,依據其電荷質量比的不同數值分析出一級質譜圖,再藉由分析二級質譜圖可以得到蛋白質的胺基酸組成,但有別於蛋白質ID,蛋白質序列鑑定的服務會先評估蛋白的序列選用除了Trypsin以外的各種蛋白酶將蛋白質水解,再進行後續的LC/MS/MS分析。

服務流程

 

 

實驗交期:約2

樣本需求

純化蛋白質序列鑑定

  1. 樣品類型: 已知序列之純化蛋白質

  2. 樣品總量: ≥20 pmol (~1 ug for 50 kDa 蛋白質)

  3. 樣品濃度: ≥2 pmol/uL (~0.1 ug/uL for 50 kDa 蛋白質)

  4. 樣品純度: ≥50%

  5. 分析平台: 1DLC, LTQ-Orbitrap MS​​​

 

純化蛋白質分子量鑑定

  1. 樣品類型: 純化蛋白質(≤70 kDa)

  2. 樣品總量: ≥100 pmol (~5 ug for 50 kDa 蛋白質)

  3. 樣品濃度: ≥10 pmol/uL (~0.5 ug/uL for 50 kDa 蛋白質)

  4. 樣品純度: ≥50%

  5. 分析平台: 1DLC, LTQ-Orbitrap MS
出貨規格

1. 結案報告一份

2. Raw data 一份

常見問題

Q1. 一定要提供蛋白序列嗎?

A:由於質譜的定序方法是藉由和data base的比對推算並確認其胺基酸的組成,所以一定要提供蛋白質的序列。

 

Q2. 和蛋白質ID的服務項目同是鑑定胜肽來確認蛋白質,那兩者的差異在哪?

A:蛋白質序列鑑定的原理和蛋白ID的原理相同,但蛋白質序列鑑定會為了要將全部的蛋白質序列鑑定到(我們的guarantee鑑定到氨基酸95%以上),我們會分析蛋白序列後選用適合的蛋白酶來水解蛋白。

 

Q3. 有什麼樣的生物性樣本需要特別注意?

A: 蛋白質序列鑑定的服務,一定需要提供蛋白質的序列,另外就是蛋白質的純度需要>50%以上。

 

Q4. 蛋白質分子量測定有什麼限制?

A: 分子量大小不超70kDa.

 

Q5. 可以測核酸的分子量嗎?

A: 可以,樣品純度要高(>90%較佳), 主要是不可以含有鹽類(會影響分析), 量約10nmol, 體積不可超過100ul。

 

Q6. 膠體樣品有什麼限制嗎?

A: 膠體樣品請勿超過3x8x1.5mm,若膠體樣品超過此大小會酌收膠體處理費用。序列鑑定不建議給予膠體樣品,會影響peptide elution的效率,降低coverage。

 

其他常見問題請至FAQs

訂閱圖爾思電子報

您可以從電子郵件中得到我們最新的消息與資訊

訂閱服務確認

已發送 Email 驗證信給你,請點擊信件連結以完成訂閱程序

訂閱失敗

暫時無法接受訂閱,請稍候重新嘗試