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原創文章 引用請註明出處 相關性分析（correlation analysis）是研究隨機變量相關性的一種統計方法，用於研究現象之間是否存在某種依存關係，並對具有依存關係的現象探討其相關方向以及相關程度。這次小編就來為大家詳細介紹論文中常見的『優勢物種相關係數分析』及『物種關聯網絡分析』～～ 優勢物種S...
原創文章 引用請註明出處 精準醫療是近年來最熱門的話題，醫學界與科學界無一不投注心力在個人化醫療上，而過去研究都將重點放在人類基因體個體化差異與藥物作用上，但已有越來越多的研究指出藥物作用不僅受到基因調控的影響，也會因體內微生物的結構而有所差異[1, 2]。先前小編報導過目前已知超過60個藥物效果...
原創文章 引用請註明出處 隨著大眾對於腸道菌的認識日益漸增，不少研究學者以及專家提倡以改變腸道菌相來達到治療疾病或是調整體質的做法。俗話說得好：「民以食為天」，人類自古以來便十分重視「吃」這件事，不只要吃得飽，更要吃得好。呼應今天的主題，小編想從腸道菌的角度出發，跟大家談談如何吃得巧，養出和...
原創文章 引用請註明出處 今天小編來分享一下微生物分析中常用的Beta Diversity，其中有幾款視覺化樣本分組比較分析最為常見，我們就來一一介紹吧！ PCA分析 主成分分析（PCA, Principal Component Analysis），是一種應用方差分解，對多維數據進行降維，同時保持數據集中雙方差貢獻最大的特徵，從而有效地找出...
原創文章 引用請註明出處 研究細胞生理途徑(cellular pathways)的人有福了！無論是研究癌症相關途徑、細胞層次免疫反應，或是特定代謝途徑，隨著次世代定序技術的進步，以往耗時耗財的細胞途徑研究將有突破性的發展。在2016年陸續有頂級期刊發表Perturb-seq的運用，以單一基因和單一細胞的解析度，將複雜的細胞調...
近年來，由於次世代定序 (Next generation sequencing, NGS) 的技術演進以及定序成本漸趨低廉，以往所費不貲的基因體研究大為盛行。NGS 在學術以及臨床應用的潛力不只體現在腫瘤基因體與孕婦非侵入式產前檢測，近年備受矚目的是基於 NGS 基礎在微生物體學的研究，其中人體腸道菌相更是研究的熱點。目前已知腸道菌對於人類...
原創文章 引用請註明出處 今天這篇是小編頭一次以專文介紹單一種的腸道細菌，這樣的特殊待遇可是其他腸道細菌還沒有的呢，所以看倌們可要擦亮眼睛，看看這隻細菌到底special在哪裡。說起Akkermansia muciniphila(以下簡稱A. muciniphila)，最親民的維基百科上可以找到牠的基本資料： (1) 絕對厭氧的革蘭氏陰性菌...
原創文章 引用請註明出處 隨著生物學的次世代定序以及其他多種高通量分析技術的發展，人類的醫學也逐漸邁向一個新的里程碑：精準醫療 (precision medicine)。歸功於先進的次世代定序技術以及日益降低的定序成本，科學家們已經知道人類腸道菌的基因體總和大約是人類自身基因總數的一百倍。如此龐大的腸道菌基因...
原創文章 引用請註明出處 今年(2016)11月28日國衛院高承源老師與清華大學合作的一項研究計劃，發表在頂級期刊Nature Microbiology上，他們的研究成果為控制人類肥胖帶來一絲曙光。研究團隊針對DUSP6(雙特異性蛋白磷酸酶6)在腸道菌和肥胖的作用做了深入的探討，利用小鼠做為模式動物，發現剔除dusp6對於小鼠的...
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