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原創文章 引用請註明出處 長讀長的三代定序在總體基因體 (Metagenome) 研究上，到底有什麼優勢呢？ 在2020年的一篇文獻中，利用電腦模擬方式去比較二代定序以及三代定序技術去定序真核生物總體基因體。結果發現長讀長可以增加動植物基因體的召回率 (recall rate)，當讀長從 300 bp 增加至 4,000 bp 時，召回率...
原創文章 引用請註明出處 抵押所有人品! 召喚~~~神...隊友!? 世人都知道神隊友的出現，可遇不可求，有時候賭上所有人品也抽不到一張好牌 (泣 但是! 神...肩膀的存在是已知的，只需要設定目標仔細挖掘一定會獲得寶藏的 現在，閱讀本篇的看倌們請跟我們一起直達大神們的肩膀吧! 大神一號 (大神排名不分先後...
原創文章 引用請註明出處 今天這篇文章小編感覺是不小心收了 PacBio 紅包而寫的?! 開玩笑的啦~ 人家 PacBio 就真的有實力，我們只是據實以告而已。 本文以 2022 年 5 月發表在 Cell Genome的 FDA 真實挑戰賽 V2 為主軸[1]，跟大家分享 FDA 真實挑戰賽在做什麼，以及這次參賽選手們的表現如何~ 什麼是FDA真...
原創文章 引用請註明出處 ㄅㄨ~ㄅㄨ~三代定序的讀長無限列車開往臨床應用領域囉~ 搭乘旅客注意: 列車上禁止進食便當，以免跟炎柱大哥一樣開打前吃太多便當就......領了便當 (圖／翻攝自Muse木棉花-TW YouTube) 在過去的幾年裡，三代定序平台如 PacBio 和 Oxford Nanopore Technologies (ONT) 的單分子...
腸道菌、代謝物對疾病的影響可能不是單一隻菌或單一個代謝物導致，而是菌群與多種代謝物交互作用導致的結果。要探討因果關係，除了找尋相關文獻對單一交互作用的in vitro 或 in vivo 驗證和使用無菌鼠以及特定菌株驗證外，另一種方式則是利用『大數據』加上『生物資訊分析』來進行腸道菌、代謝物與疾病間的因果關係探討。 ...
原創文章 引用請註明出處 時光飛逝，在四月的時候發表了人類完整基因體序列 （傳送門：人類完整基因體問世），其實不只是人類，其他物種也陸續發表了染色體從端粒到端粒的完整序列文獻。這篇文章就來跟大家淺談這些文獻的內容吧！ 1. 稻米[1] 背景介紹： 在2021年發表的文獻中，使用了 PacBio HiFi 和 C...
|| 做微生物體數據分析時，常遇到以下情況? 花了近2個月的時間取得了FL16S (Full-Length 16S)的數據，打開報告結果... ⚠ 找不到適合呈現的方法 ⚠ 界門綱目科屬種，階層資料閱讀不便 ⚠ 想小小調整圖上顏色、大小，卻需要再花一筆錢與溝通等待時間 想要客製化圖表錯了嗎 ？！(;´༎ຶД༎ຶ`) 別怕別怕，找 圖爾...
原創文章 引用請註明出處 降肉！！ 500 英尺~ 300 英尺~ 100 英尺~ 降肉！！ 肉在這裡!! 有在追蹤 Nanopore 進展的各位一定知道，就在五月底 Nanopore 剛剛結束了一年一度的 London Calling 大會，現在就讓我們一起來看看今年 Nanopore 端出了什麼樣的大菜吧！ 摘要 首席技術官 Clive Brown 及其同...
原創文章 引用請註明出處 去年發布從端到端，三代定序提供人類完整基因體資訊，那時還在文章中討論到五月有完整人類基因體的草稿文獻正在同濟審核中。時間飛快一年就過去了，在今年 4/1 愚人節，Science 期刊連發了六篇與人類完整基因體相關的文獻，其中登上封面的就是這篇：The complete sequence of a human g...
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