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原創文章 引用請註明出處 你是否聽過 Nanopore 定序的蛋白通道活性非常不穩定? 你是否持續聽到身邊的人說 Nanopore 定序錯誤率好高高? 你是否聽到大家都說 Nanopore 的數據需要合併 Illumina 的數據進行校正才足夠準確? 但是， 你是否查證過這些消息是 Nanopore 定序剛進入定序市場的評價還是現今...
原創文章 引用請註明出處 長讀長的三代定序在總體基因體 (Metagenome) 研究上，到底有什麼優勢呢？ 在2020年的一篇文獻中，利用電腦模擬方式去比較二代定序以及三代定序技術去定序真核生物總體基因體。結果發現長讀長可以增加動植物基因體的召回率 (recall rate)，當讀長從 300 bp 增加至 4,000 bp 時，召回率...
原創文章 引用請註明出處 抵押所有人品! 召喚~~~神...隊友!? 世人都知道神隊友的出現，可遇不可求，有時候賭上所有人品也抽不到一張好牌 (泣 但是! 神...肩膀的存在是已知的，只需要設定目標仔細挖掘一定會獲得寶藏的 現在，閱讀本篇的看倌們請跟我們一起直達大神們的肩膀吧! 大神一號 (大神排名不分先後僅...
原創文章 引用請註明出處 ▌案件大綱 品項: Whole Genome Sequencing 定序平台: Oxford Nanopore Technologies PromethION 樣品物種/類型: 鳥類 DNA 欲解決案件難題: 案主希望進行鳥類基因體的發表，因此委託圖爾思進行三代定序，雖然準備的樣品 DNA 完整度很好，但是一開始定序產出不盡理想...
原創文章 引用請註明出處 ▌案件大綱 品項: 動物基因體定序 定序平台: Oxford Nanopore Technologies-PromethION 樣品物種/類型: 魚類/組織 欲解決案件難題: 案主有一基因轉殖斑馬魚，雖已知轉殖基因序列但不知道該序列插入的基因體位置，所以無法進行後續實驗驗證， 需要選擇合適的定序平台且進行客...
原創文章 引用請註明出處 ▌案件大綱 品項: 動物基因體定序 定序平台: PacBio Sequel IIe 樣品物種/類型: 魚類/組織 欲解決案件難題: 客戶欲定序手中的魚類物種，該物種已於 Illumina 定序平台與 Nanopore MinION 定序平台完成定序，但由於該魚類物種重複序列占比高達 30~40%，依靠既有的數據進行組裝...
單細胞定序技術雖然逐漸普及於不同的研究領域，但是對於細胞品質的高度要求，一定程度限制了樣品來源的類型以及上機時間地點，讓研究人員仍然有許多大膽的想法等待著被實踐，而甫於2022年推出的 Single Cell Fixed RNA Profiling Kit，能固定細胞當下的狀態並保存，不再受到樣品製備後須立刻上機的時間限制。 Figure 1 不...
原創文章 引用請註明出處 ▌案件大綱 品項: Whole Genome Sequencing / Iso-Seq 定序平台: PacBio Sequel IIe 樣品物種/類型: 昆蟲 DNA / RNA 欲解決案件難題: 客戶希望進行昆蟲基因體的發表，因此委託圖爾思進行三代定序和分析，但是在樣品製備步驟就卡關，準備的樣品一直無法通過品質檢驗。 解方: 經...
原創文章 引用請註明出處 ▌案件大綱 品項: Whole Genome Sequencing 定序平台: Oxford Nanopore Technologies PromethION 樣品物種/類型: DNA病毒 / 純化 gDNA 欲解決案件難題: 客戶曾經委託其它廠商進行 PacBio 病毒全基因體定序，發現組裝基因體大小與實驗預期不符，缺失資訊佔整個基因體高達 20%...
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