蛋白質定量分析
服務內容
樣本經過trypsin處理後，透過化學反應將iTRAQ試劑的反應基團（amine specific peptide reactive group）與胜肽段的氨基末端共價連接在一起（下圖）。不同樣本的胜肽段分別被iTRAQ114-117(以四個樣本為例，下圖”1”)的標籤標記。
將標記好的4組胜肽段混合後，進行LC-MS/MS分析。由於4組樣品中相同蛋白質的同一條胜肽段被4種iTRAQ試劑分別標記後，其質量(M)仍然是一樣的(4種同位素標籤搭配不同平衡團後其總質量為相同)。所以在一級質譜上(MS1)，它們的m/z (mass-to-charge ratio)值是相同的(下圖”3”)。經過碎裂反應後產生的碎片離子（fragment ions），可透過資料庫的搜尋推出該胜肽段為哪個蛋白質。而胜肽段上釋放出來的4個報告基團標籤—114、115、116、117的強度即代表了4組樣品同一胜肽段的豐度（abundance）（下圖”4”）。
服務流程
交期：約 15-20工作天
樣本需求
蛋白體定量分析: 基本/標準/進階分析
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樣品類型: 細胞團塊 (cell pellet)、萃取蛋白質溶液(請提供溶液成分)
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樣品總量: 每組樣品量 ≥5 ug (基本)、≥10 ug (標準)、≥20 ug (進階)
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樣品濃度: ≥0.5 ug/uL (基本)、≥1 ug/uL (標準)、 ≥2 ug/uL (進階)
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特殊限制: 溶液介面活性劑 (Detergent) 比例: ≤0.2%、Urea (≤1 M)；溶液成分不含: Tris、Ammonium Salt、Gly-gly、DTT、Mercaptoethanol
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分析平台: online-2DLC LTQ-Orbitrap MS
磷酸化蛋白體定量分析: 基本/標準/進階分析
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樣品類型: 細胞團塊 (cell pellet)、萃取蛋白質溶液(請提供溶液成分)
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樣品總量: 每組樣品量 ≥10 ug (基本)、40 ug (標準)、100 ug (進階)
- 樣品濃度: ≥0.5 ug/uL (基本)、≥1 ug/uL (標準)、 ≥2 ug/uL (進階)
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特殊限制: 溶液介面活性劑 (Detergent) 比例: ≤0.2%、Urea (≤1 M)；溶液成分不含: Tris、Ammonium Salt、Gly-gly、DTT、Mercaptoethanol
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分析平台: online-2DLC LTQ-Orbitrap MS
出貨規格
1. 結案報告一份
2. Raw data 一份
