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04 2022.03

【RNAseq分析對決 -- 嚴謹 vs. 簡單】


|| QC 和 Mapping 不能簡單 ||


到底是這家的RNAseq服務吸引人,還是那家的RNAseq服務令人嚮往?

 

本集對決內容 --  嚴謹 vs. 簡單

 

好的開始是成功的一半
有好的數據品質,才能有好的分析結果!

 

  1. 數據真的OK嗎? QC真的不嫌少!
  2. QC結果一堆數值好難懂 
  3. Mapping的方式有差嗎?

 

 

你對品質控管真的安心嗎?

這家的 嚴謹 和 那家的 簡單,對決結果會是如何??
誰"毋"簡單?  看了就知道!


 

數據真的OK嗎? QC真的不嫌少!

 

簡單

Clean FASTQC,一份給你。
 

嚴謹

圖爾思提供嚴謹的QC流程(Raw FASTQC、Filter Result、物種檢定、基因覆蓋率),

每一步檢查步驟都讓你清楚知道,在分析的初期就能即時反應樣本問題,提早發現,提早解決!

 

了解更多序列品質控管細節,請見【RNAseq序列品質控管】。

 

▲QC結果一堆數值好難懂

簡單

給你幾張簡單的correlation圖。
 

嚴謹

圖爾思提供更多樣化的樣本觀察方式,快速了解樣本間的差異與數據品質狀況,例如我們提供您:exon/intron比例圖、數據清理比例圖,數據狀況清晰可見

圖片種類包括:Scatter plot、相關係數、長條圖、PCA…。


▲Mapping的方式有差嗎?

 

簡單

使用Transcript進行Mapping。
 

嚴謹

圖爾思使用Genome進行Mapping,相較於使用transcript,能得知更多資訊,包括:exon比例、intron、UTR等RNA建庫細部狀況。
 


在日常生活中,各類產品都會進行QC來確保食用與使用的東西安全無疑。

在定序服務的產品上,我們嚴格看待提供給科學家的數據品質,好的數據才能有可信度高的結果!

 

QC和Mapping也可以很不簡單,下集 大眾 vs. 小眾 ,RNAseq分析對決,下次見!

 

> 更多RNAseq服務內容

> 與我們聯繫:ngs@toolsbiotech.com


 

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