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許多研究人員會想要知道自己的樣本與對照組之間，蛋白質差異有多少，利用質譜儀(Mass spectrometry, MS)進行觀測，並透過軟體分析可以獲得差異蛋白(Differential protein)的結果，但是要如何進行後續的數據分析呢?就讓兔編來告訴大家 ! 除了找出含量有差異的蛋白質以外，越來越多研究也會透過基因的資料(differentially ...
|| DEG差異基因分析 || 到底是這家的RNAseq服務吸引人，還是那家的RNAseq服務令人嚮往? 本集對決內容 -- 大眾 vs. 小眾 關鍵的步驟，需要眾多的支持 差異基因的統計方法這麼多種，這種方法好嗎? 有沒有更多差異結果的呈現方法呢? 不論是實驗設計，或是選擇分析方法前，總會查詢文獻，並選擇Citation次數...
原創文章 引用請註明出處 上一篇文章跟大家分享了三代定序龍頭 Oxford Nanopore Technology (ONT) 在 2021 年的 21 件重要小事，怎麼可以錯過同為三代定序的龍頭 Pacific Bioscience (PacBio) 在 2021 年的進展呢？咱們輸人不輸陣，趕緊來看看在過去一年中，PacBio 發生了哪些重要事情吧！ 本文主要架構取材 Pac...
|| QC 和 Mapping 不能簡單 || 到底是這家的RNAseq服務吸引人，還是那家的RNAseq服務令人嚮往? 本集對決內容 -- 嚴謹 vs. 簡單 好的開始是成功的一半 有好的數據品質，才能有好的分析結果！ 數據真的ＯＫ嗎？ QC真的不嫌少！ QC結果一堆數值好難懂 Mapping的方式有差嗎？ 你對品質控管真的安...
|| 從"頭"開始的細心 || 到底是這家的RNAseq服務吸引人，還是那家的RNAseq服務令人嚮往? 本集對決內容 -- 有跡可循 vs.無跡可尋 // 拿到RNAseq分析結果，是否會遇到以下情況? // 打開資料夾，看不懂檔案名稱 找不到需要的檔案位置 看不懂圖片/分析內容 才剛開始要閱讀數據就卡關碰瓷？！ 這家...
細胞移動 (Cell migration)對生物體至關重要，此機制仰賴胞器和細胞骨架纖維之間的功能和協調；因此細胞移動反映了細胞的發展程度，如果沒有移動的能力，細胞就無法生長、分裂或擴展區域。從事癌症研究、傷口癒合或藥物發現的科學家們皆經常需要利用細胞移動性實驗探討可能影響細胞生理過程和功能的條件和物質，因此體外細...
【單細胞定序 新知分享】DISCO- 整合型單細胞圖譜參考資料庫 DISCO (Deeply Integrated Single-Cell Omics data) 是甫於2022年初發表的單細胞數據資料庫，深度整合多個單細胞技術平台將近4593例樣品，累積超過一千八百萬顆細胞的研究數據，涵蓋將近107種的組織/細胞/類器官 (organoid)，其中也包含相當多來自COVID-19相關...
3D細胞培養與2D細胞培養的比較 2D細胞培養已經被廣泛用於研究細胞和疾病機制，然而研究指出與2D培養系統相比，3D培養細胞的方式能反映組織中的微環境狀態。因此透過3D培養的方式，細胞的狀態與反應情況更接近於活體內，因此能提供更多的生理資訊 [1]。 在過去的十年研究中，3D培養已被用作藥物篩選平台、腫瘤細胞生物學...
原創文章 引用請註明出處 各位捧油~新年快樂!! 過完了一個農曆年讓人真正感覺 2021 年已經離我們遠去，祝福大家 2022 年都能邁向更好的自己(●’◡’●) 本篇譯自 Oxford Nanopore 官網 [1]，統整了 2021 年 Nanopore 本身技術或其使用者取得的關鍵進展，相信有些進展會讓你感到激勵人心、有些進展會...
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