蛋白質定性分析
樣本中的蛋白質經由酵素水解成小片段的胜肽段後，圖爾思使用高分辨率的LC-MS/MS儀器 (Orbitrap Elite ETD)，依胜肽特性進行初步分離後，再通過質譜儀第一段質量分析器分離不同質荷比之肽段。由第一段質量分析器選擇誘導碰撞解離的肽段將會被分離為 y- 或 b- 離子，而這些離子被第二段質量分析器分離，通過計算相鄰的 y- 或 b- 離子的質量差異，即可計算出該胜肽的序列。
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單一蛋白質-序列/分子量/純度/胜肽圖譜鑑定
定序的原理和蛋白質ID相同，利用蛋白酶將樣本中的蛋白水解成小片段的胜肽段後，通過質譜儀分析每一段胜肽，依據其電荷質量比的不同數值分析出一級質譜圖，再藉由分析二級質譜圖可以得到蛋白質的胺基酸組成，但有別於蛋白質ID，蛋白質序列鑑定的服務會先評估蛋白的序列選用除了Trypsin以外的各種蛋白酶將蛋白質水解，再進行後續的LC-MS/MS分析。
項目包含：
送樣須知、實驗需求單以及Protein extraction protocol請參閱樣品處理網頁附件。
項目包含：
| 服務名稱 | 服務說明 |
|---|---|
| 單一蛋白質-純度測定-UV (Purity-UV) | 以 UV 214/280 nm 吸光值測定純度。 |
| 單一蛋白質-分子量測定 (Protein M.W.) | 蛋白質純度需 >50% |
| 單一蛋白質-已知序列鑑定 (Sequence ID) | 將已知的單一蛋白質以不同酵素(2~3個酵素)進行序列分析，蛋白純度需＞50% ，序列覆蓋率可達＞95% |
| 單一蛋白質-未知序列定序 (De novo sequencing) | 將已知的單一蛋白質以不同酵素(2~3個酵素)進行序列分析，蛋白純度需＞95% ，序列覆蓋率可達＞95% |
| 單一蛋白質-N端定序 (N-terminal sequencing) | 蛋白質純度需 >95%，提供蛋白質N端序列解序 (7-20 胺基酸) |
| 單一蛋白質-胜肽圖譜分析 (Peptide mapping) | Refernce protein 及 Target protein Peptide Mapping 結果 |
| 混和物-分子量分佈分析 (Peptides M.W.) | 檢測樣品內分子的分子量分布(0.3-20 kDa)，不提供鑑定結果 |
| 混和胜肽-未知序列定序 (Peptide sequencing) | 提供樣品內胜肽可能之胺基酸序列解序(無法區分Leu/Ile) |
送樣須知、實驗需求單以及Protein extraction protocol請參閱樣品處理網頁附件。
蛋白質身份鑑定 (DDA)
圖爾思提供的蛋白質身份鑑定 (Protein ID) 技術服務讓您用最快速最準確的方式偵測樣本中的蛋白質組成份，利用質譜大規模地鑑定出樣本的組成，比起利用抗體等間接鑑定的方法更可以避免受到抗體專一性的影響。
我們提供多種樣本類型的分析服務，包含細胞pellet、動植物組織、分泌囊泡、膠體、血清、血漿...等，從樣品製備、上機、到最終生物資訊分析，圖爾思提供一條龍的技術服務。
項目包含：
送樣須知、實驗需求單以及Protein extraction protocol請參閱樣品處理網頁附件。
我們提供多種樣本類型的分析服務，包含細胞pellet、動植物組織、分泌囊泡、膠體、血清、血漿...等，從樣品製備、上機、到最終生物資訊分析，圖爾思提供一條龍的技術服務。
項目包含：
| 服務名稱 | 服務說明 |
|---|---|
| 水解胜肽身分鑑定-基本分析 | 1. 鑑定蛋白質數目: 100-1,000 (基本), 100-3,000 (標準/進階) 2. 膠體以3x8 mm 為單位面積，超過酌收樣本處理費 (上限加2單位) 3. 膠體取樣以單一區域(band/spot)為主，額外取樣每區需增收費用 4. 請提供蛋白質萃取液配方，評估是否進行質譜分析干擾物去除服務 5. 若欲檢測目標蛋白質，請在送件單上註明並提供該蛋白質序列 6. 客戶未提供蛋白質濃度時，需加做蛋白質溶液濃度測量 7. Biotin及 IP 產物 (beads) 請依 post-IP procedure 處理，並去除多餘之上清液 8. 提供一組 database 比對之結果 (Database: UniProt or NCBI Refseq or Customized database) 9. 外泌體允收標準請參考：Extracellular Vesicles Proteomics Services |
| 電泳膠體蛋白質身分鑑定 基本分析 | |
| 蛋白液體蛋白質身分鑑定 基本分析 | |
| 生物素純化蛋白質身分鑑定 基本分析 | |
| 免疫沉澱蛋白質身分鑑定 基本分析 | |
| 外泌體蛋白質身分鑑定 基本分析 (digestion) | |
| 外泌體蛋白質身分鑑定 基本分析 (shaving) | |
| 蛋白質身分鑑定-質譜標準分析 (5-fractions GeLC/2DLC) | |
| 蛋白質身分鑑定-質譜進階分析 (24-fractions 2DLC) | |
| 蛋白質身分鑑定-客製分析 (ID Customized) |
送樣須知、實驗需求單以及Protein extraction protocol請參閱樣品處理網頁附件。
