生物資訊分析
透過 Proteome Discoverer 軟體進行運算分析，我們可以篩選出差異蛋白的詳細數據。接著，利用 clusterProfiler 軟體進行基因富集(enrichment)分析，包括生物學過程(biological process)、分子功能(molecular function)和細胞成分(cellular component)等 GO 類別，以反映差異蛋白在基因表現上的狀況。同時，透過 KEGG 分析能夠深入了解蛋白質的生物途徑和功能。PPI 分析則提供了在富集基因中相互作用和作用強度的網路關係。
圖爾思致力於為客戶提供更豐富的數據分析服務。在數據分析後，我們更提供完整的製圖與列表服務，包括 Directed acyclic graph、Barplot、Dotplot、Networkplot、Upset 等。這些工具使您能夠清晰地了解樣本中基因和蛋白之間的差異性。
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圖爾思致力於為客戶提供更豐富的數據分析服務。在數據分析後，我們更提供完整的製圖與列表服務，包括 Directed acyclic graph、Barplot、Dotplot、Networkplot、Upset 等。這些工具使您能夠清晰地了解樣本中基因和蛋白之間的差異性。
服務內容
生物資訊分析項目包含：
送樣須知、實驗需求單以及Protein extraction protocol請參閱樣品處理網頁附件。
| 服務名稱 | 服務說明 |
|---|---|
| 無標記蛋白質定量 (Label-free Quant) | 以蛋白圖譜數(PSM)進行相對定量，提供蛋白質定量結果(Label-free) |
| 客製化序列比對分析 (Customized database) | 提供客製化蛋白質資料庫建立(資料不需特殊處理者) |
| 差異蛋白列表分析 (Differential protein analysis) | 以蛋白訊號強度(Peak area)進行相對定量，提供蛋白質定量結果(Label-free) |
| 基因功能性分析 (Gene ontology enrichment) | 以客戶提供的蛋白質列表進行 GO enrichment |
| 代謝與調控路徑分析 (Pathway enrichment) | 以客戶提供的蛋白質列表進行 pathway enrichment |
| 二維電泳影像分析 (2DE image analysis) | 以二維蛋白質體影像(TIF)進行蛋白質/總蛋白質占比分析(%) |
| 資訊分析服務-客製化 (Customization) | 提供客製化的蛋白體定量、生物資訊分析及圖表呈現服務 |
| 製圖服務 (Pie chart/Bar chart) | 請先來信洽詢資料來源及繪圖細節， 提供一次免費修改，在原始的資料內，修改圖內字的大小以及顏色，視為修改。 只要原始繪圖的資料有大幅度的變動(例如原始資料數值完全消失)，皆會視為製作新圖，而非修改。 |
| 製圖服務 (Venn diagram/Volcano plot) | |
| 製圖服務 (Heat map) | |
| 製圖服務 (KEGG pathway map) | |
| 製圖服務 (Customization) |
送樣須知、實驗需求單以及Protein extraction protocol請參閱樣品處理網頁附件。
