蛋白質身分鑑定 (DIA)
蛋白質是執行細胞功能的重要分子，其表現量與功能變化可反映細胞的生理狀態、疾病進程及藥物反應。因此全面掌握不同樣品或實驗組別間的蛋白質表現量差異，是疾病機制研究、生物標誌物探索及藥物開發的重要基礎。
隨著蛋白質體研究朝向多樣本、高通量及高精準度分析發展，數據完整性、定量穩定性與跨樣品重現性也成為研究設計的重要考量。
DIA (Data-Independent Acquisition, 數據非依賴型採集) 能廣泛且一致地收集樣品中的胜肽訊號，降低數據採集的隨機性及樣品間的缺失值，協助研究人員更完整地解析蛋白質表現量變化，為後續功能研究與候選標誌物驗證提供可靠的數據基礎。
服務內容
DIA 是一種高通量質譜蛋白質體分析技術，可對樣品中的蛋白質進行大規模鑑定與相對定量。相較於傳統的 DDA (Data-Dependent Acquisition)，DIA 不依賴特定前驅離子的即時挑選，可系統性地收集設定範圍內的離子訊號，更搭配最新人工智慧與深度學習蛋白質鑑定軟體，提升不同樣品間的數據完整性、定量穩定性及分析重現性。
本服務涵蓋樣品前處理、蛋白質酵素水解、LC-MS/MS 分析、蛋白質鑑定與相對定量，並可依研究需求進行差異蛋白篩選及生物資訊分析，適用於：
本服務涵蓋樣品前處理、蛋白質酵素水解、LC-MS/MS 分析、蛋白質鑑定與相對定量，並可依研究需求進行差異蛋白篩選及生物資訊分析，適用於：
- 多組別及大樣本數比較
- 差異蛋白質篩選
- 生物標誌物探索
- 疾病機制研究
- 藥物反應及作用機制評估
- 大規模蛋白質體研究
原理說明
DIA 分析會將設定的質荷比 (m/z) 範圍劃分為多個連續的隔離區間，質譜儀依序掃描各區間，並將區間內的前驅離子共同碎裂與偵測，以廣泛且一致地採集 MS/MS 訊號。
分析軟體會整合前驅離子與碎片離子的質荷比、滯留時間及訊號強度等資訊，進行胜肽與蛋白質的鑑定計算出相對定量。由於所有樣品皆採用一致的數據採集模式，可降低傳統數據依賴型採集 (DDA) 中前驅離子選擇的隨機性，提升跨樣品比較的完整性與一致性，特別適合多組別及大樣本數的蛋白質表現分析。
服務流程
樣品前處理 → 蛋白質酵素水解 → LC-MS/MS 分析 → 蛋白質鑑定與定量 → 差異蛋白質篩選 → 生物資訊分析
