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Next-Generation Sequencing
Metatranscriptome
Metatranscriptome Sequnecing
Metatranscriptome Sequnecing
總體轉錄體是指特定時間從環境樣本中定序所有的 RNA (RNAseq)來研究轉錄體的功能,並告訴我們在特定微生物環境中高度表現的基因,和該環境下富集的代謝路徑。
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分析流程
樣品需求
1. RNA 總量:
1. Illumina 平台定序:≧ 2 μg
2. RNA 濃度:≧ 50 ng/ ul
3. 樣品體積:≧ 40 ul
2. 樣品純度及片段完整性:
OD
260
/OD
280
:1.8 ~ 2.0
OD
260
/OD
230
:
≧
2.0
RQN 值:≧ 6.5,baseline 平整
建議先行以電泳膠圖確認片段大小及DNA完整度,並於送件時提供膠圖結果
定序規格
NovaSeq X Plus , paired-end 150 bp
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