Eukaryotic Small RNA-Seq
小分子RNA多為非轉譯RNA,包括miRNA、siRNA、 snoRNA…等,具有調控基因表現的功能。此項技術可以鑑定樣本中大部分small RNA的種類和數量。
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樣品需求
1. RNA 總量:
Total RNA
1. Illumina 平台定序:≧ 4 μg 2. RNA 濃度:≧ 50 ng/ μl
3. 樣品體積:≧ 40 μl
Exosome RNA
1. Illumina 平台定序:≧ 40 ng 2. 樣品體積:≧ 15 μl
3. Peak between 25-200 nt, FU> 10, no peak > 2000 nt
2. 樣品純度及片段完整性: OD260/OD280:1.8 ~ 2.0
OD260/OD230:≧ 2.0
RIN 值:≧ 7.5 (動物樣本);≧ 7.0 (真菌或植物樣本)
建議先行以電泳膠圖確認片段大小及RNA完整度,並於送件時提供膠圖結果
Total RNA
1. Illumina 平台定序:≧ 4 μg 2. RNA 濃度:≧ 50 ng/ μl
3. 樣品體積:≧ 40 μl
Exosome RNA
1. Illumina 平台定序:≧ 40 ng 2. 樣品體積:≧ 15 μl
3. Peak between 25-200 nt, FU> 10, no peak > 2000 nt
2. 樣品純度及片段完整性: OD260/OD280:1.8 ~ 2.0
OD260/OD230:≧ 2.0
RIN 值:≧ 7.5 (動物樣本);≧ 7.0 (真菌或植物樣本)
建議先行以電泳膠圖確認片段大小及RNA完整度,並於送件時提供膠圖結果
定序規格
NovaSeq X Plus , single-end 50 bp

