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原創文章 引用請註明出處 FAPROTAX (Functional Annotation of Prokaryotic Taxa)是 Louca 等人為解析微生物群落功能於 2016 年創建的資料庫,主要基於原核微生物分類的功能註釋並在2016年發表於Science [1]。 FAPROTAX 可適用於對環境樣本(如海洋、湖泊等)的生物地球化學循環過程(特別是碳、氫、氮、磷、...
第二屆基因產業論壇於今日在臺北醫學大學熱烈舉行,本屆由臺北醫學大學藥學院、臨床藥物基因體學暨蛋白質體學碩士學位學程主辦,由基因線上協辦,共邀請十七家生技廠商代表分享他們的豐富經驗和對精準醫學的精闢見解,讓有志投入該領域的學子們,深入了解這個當紅產業的各個面向。 大會邀請臺北醫學大學吳介信副校長、衛...
原創文章 引用請註明出處 Tax4fun是一個以R 語言開發的基因功能預測套件,能依據 16S 數據進行菌群功能預測。與 PICRUSt 同是基於 marker gene 進行總體基因體功能預測的工具。相較 PICRUSt 推斷序列共同祖先後預測基因功能,Tax4fun 是基於透過 KEGG 原核基因體註釋資訊的序列直接地進行基因功能預測。Tax4Fun ...
原創文章 引用請註明出處 目前研究的趨勢已從多樣性分析 (16S/18S/ITS) 進入到總體基因體 (Whole Metagenomic Sequencing) 的時代。但相較 16S rRNA 定序,總體基因體定序及分析複雜且昂貴許多,因此如何從大量的多樣性定序樣本中,篩選出具代表性、感興趣且欲深入探討功能的樣本,便顯得相當重要! 但有...
原創文章 引用請註明出處 國人往往疏忽口腔健康問題,根據衛福部統計,台灣2~3歲兒童蛀牙率約 31%,到了6歲蛀牙率更增加到 79%,而成年人也有近8成有牙周病問題。每年3月20日是「世界口腔健康日」,讓我們一同以科學研究成果關心口腔微生物與口腔健康的關係吧! 口腔微生物與齲齒、牙菌斑、牙結石、牙...
多體學與生物資訊讓微生物研究更全面 香港中文大學黃憲達教授表示在定序技術越來越步的時代下,產生數據很容易,各國政府和生醫產業界都投入很多資源以產生醫學、微生物、疾病、生物標記、診斷治療等相關數據,然後再進行分析。 目前市面上有四大定序平台包含 Illumina、Thermofisher、Pacific Biosciences、Oxford Nanpor...
由中央研究院、長庚大學微生物相研究中心、臺北醫學大學、圖爾思生物科技共同主辦的第三屆亞洲微生物體趨勢論壇,於2019年1月10-11日於中研院人文社會科學館盛大展開,大會規劃六大主題:人體腸道微生物、人體微生物、動植物與環境微生物、微菌叢植入術(FMT)、營養與益生菌以及生物資訊領域。 邀請全球知名專家學者和業...
原創文章 引用請註明出處 人類口腔中存在大量微生物,其中大部分為人體共生微生物菌群,口腔微生物在出生過程中經由產道與母體接觸,以及出生後從外界經由飲食、吸菸、衛生習慣等產生變化,而這些口腔微生物菌相能夠改變局部及全身的健康與疾病之間的平衡,與人體免疫系統及口腔疾病息息相關,如齲齒、牙齦...
原創文章 引用請註明出處 利用機器學習模型預測口腔疾病的發生已有不少研究,例如2015年的研究,建構齲齒預測模型達到透過口腔微生物變化早期發現疾病的發展,預測準確率達81%[1],另一篇2018發表的齲齒發生的預測模型準確度則達93.1%[2]。另外關於牙齦炎的研究,亦有利用牙菌斑菌相結構所開發的預測模型群體...
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