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|| DEG差異基因分析 || 到底是這家的RNAseq服務吸引人,還是那家的RNAseq服務令人嚮往? 本集對決內容 -- 大眾 vs. 小眾 關鍵的步驟,需要眾多的支持 差異基因的統計方法這麼多種,這種方法好嗎? 有沒有更多差異結果的呈現方法呢? 不論是實驗設計,或是選擇分析方法前,總會查詢文獻,並選擇Citation次數...
|| QC 和 Mapping 不能簡單 || 到底是這家的RNAseq服務吸引人,還是那家的RNAseq服務令人嚮往? 本集對決內容 -- 嚴謹 vs. 簡單 好的開始是成功的一半 有好的數據品質,才能有好的分析結果! 數據真的OK嗎? QC真的不嫌少! QC結果一堆數值好難懂 Mapping的方式有差嗎? 你對品質控管真的安...
|| 從"頭"開始的細心 || 到底是這家的RNAseq服務吸引人,還是那家的RNAseq服務令人嚮往? 本集對決內容 -- 有跡可循 vs.無跡可尋 // 拿到RNAseq分析結果,是否會遇到以下情況? // 打開資料夾,看不懂檔案名稱 找不到需要的檔案位置 看不懂圖片/分析內容 才剛開始要閱讀數據就卡關碰瓷?! 這家...
原創文章 引用請註明出處 #RNAseq #實驗設計 #雲平台 #3小學堂 || 3分鐘速解RNAseq分析,本周RNAseq多的是,你不知道的事 || 看完了一系列的 RNAseq 3小學堂,相信你對 RNAseq 分析結果和報告內容有了進一步的認識,你是不是躍躍欲試了呢!小編在這裡整理了幾個在過去的經驗中,一些可能會被忽略的部分...
原創文章 引用請註明出處 #RNAseq #QC #雲平台 #3小學堂 || 3分鐘速解RNAseq分析,本周介紹樣本間相關性分析 || 有無生物性重複在分析呈現上,除了 DEG分析 用的方法不同之外,還有什麼不同的地方呢? || 生物性重複做的越好,對實驗的穩定性和可靠程度是大大的加分 || 具有生物性重複的實驗樣...
原創文章 引用請註明出處 #RNAseq #QC #3小學堂 || 3分鐘速解RNAseq分析,本周介紹RNAseq序列品質控管 || 相信大家都聽過 Garbage in, garbage out 這句話,要有好的分析報告首要就是要有好的數據,那在 RNAseq 分析之前會做那些分析確認序列品質,就讓小編來一一介紹囉~! || 不要盡信 Fastqc 結果...
原創文章 引用請註明出處 #RNAseq #標準化 #雲平台 #3小學堂 || 3分鐘速解RNAseq分析,本周介紹Read count 標準化方法 || 小編偷偷問一個問題喔~ 你知道圖爾思 RNAseq 報告有3種標準化的表格,分別是: FPKM、TPM、RLE/TMM 。 看到這,是不是被這群不知是誰的標準化方法搞混了呢?又為什麼RLE後面還有接一...
原創文章 引用請註明出處 #RNAseq #WGCNA #雲平台 #3小學堂 || 3分鐘速解RNAseq分析,本周介紹WGCNA性狀關聯分析 || 上篇介紹了 WGCNA 的基本概念,你非常有興趣並興致勃勃的準備了15 個以上的樣品,卻發現報告中 WGCNA 分析的結果比別人還少,這是怎麼一回事? 小編說,本篇介紹的 WGCNA 分析內容...
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