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| | 好的生物資訊分析，帶你上天堂 | | 好的 Metagenome 結果不只需要好的樣品和定序品質，強大的生物資訊分析更是不可或缺，如何有效從序得到的短讀⻑序列中拼湊出微生物的正確樣貌，進而了解菌相組成與其中的愛恨糾葛，首要工作是選用適當的分析流程。 想像一下，如果每個物種都代表一個完整的拼圖，每個樣品就像是一大...
原創文章，引用請註明出處 ｜｜一首歌的時間，快速了解Metagenome樣品與數據品質的重要性｜｜ Metagenome樣品製備：親手建立屬於微生物們的舞台 shotgun Metagenome—這不是一把真正的霰彈槍，而是一種能夠讓你深入微生物世界的奇妙工具。這種技術讓我們能夠不經培養，直接從環境樣本中萃取DNA進行定序，揭示出...
在生物學研究中，科學家倚賴各種工具來深入探索生命的奧秘。近年來，基因編輯神器「CRISPR」技術成為研究中的巨星，其背後的核心工具Cas9蛋白能根據引導RNA (guide RNA)的指引，在目標DNA序列中進行精準的剪切，被科學家暱稱為神剪。 然而，在此之前，同樣具有DNA剪切功能的限制酶早已被廣泛應用於各類生物學研究中。...
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ddRAD (Double Digest Restriction Associated DNA) - 從案件評估、建庫、定序到分子標誌。 對於進行遺傳多樣性研究、 QTL mapping、GWAS 等等的研究人員而言，在取得合適的研究族群後，所面臨的問題將是如何大規模且有效的取得變異位點。 在定序價格持續下降的現在，以全基因體定序 (Whole genome sequencing, WGS) 定...
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|| 做微生物體數據分析時，常遇到以下情況? 花了近2個月的時間取得了FL16S (Full-Length 16S)的數據，打開報告結果... ⚠ 找不到適合呈現的方法 ⚠ 界門綱目科屬種，階層資料閱讀不便 ⚠ 想小小調整圖上顏色、大小，卻需要再花一筆錢與溝通等待時間 想要客製化圖表錯了嗎 ？！(;´༎ຶД༎ຶ`) 別怕別怕，找 圖爾...
|| 解決你篩來篩去的難題 || 圖爾思雲平台除了 RNAseq 、 scRNA 、 FL16S 外，又迎來新的項目 -- WES/WGS 啦！！！ 什麼？你說用 Excel 就可以了，還要用線上工具也太麻煩？ 當你拿到WES/WGS數據時，你可能會遇到 基因資訊有50萬甚至300萬筆，Excel打不開 Excel只能看到最多1,048,576列資訊，只好將檔案拆成好幾份 ...
原創文章 引用請註明出處 #RNAseq #QC #3小學堂 || 3分鐘速解RNAseq分析，本周介紹RNAseq序列品質控管 || 相信大家都聽過 Garbage in, garbage out 這句話，要有好的分析報告首要就是要有好的數據，那在 RNAseq 分析之前會做那些分析確認序列品質，就讓小編來一一介紹囉~！ || 不要盡信 Fastqc 結果...
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