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原創文章 引用請註明出處 Nanopore 表示: 不許再說我不準!! 準確率媲美 Illumina!! ONT 於 2022 年發表了最新推出的 Kit14 試劑，搭配 R10.4.1 晶片 系列引起了廣大的轟動，在今年終於由 Early access 階段正式進入 Release 階段，給科學家們更準、更快、更多的數據產出。 本篇幫大家快速統整R10.4.1 + ...
原創文章 引用請註明出處 你是否聽過 Nanopore 定序的蛋白通道活性非常不穩定? 你是否持續聽到身邊的人說 Nanopore 定序錯誤率好高高? 你是否聽到大家都說 Nanopore 的數據需要合併 Illumina 的數據進行校正才足夠準確? 但是， 你是否查證過這些消息是 Nanopore 定序剛進入定序市場的評價還是現今...
原創文章 引用請註明出處 長讀長的三代定序在總體基因體 (Metagenome) 研究上，到底有什麼優勢呢？ 在2020年的一篇文獻中，利用電腦模擬方式去比較二代定序以及三代定序技術去定序真核生物總體基因體。結果發現長讀長可以增加動植物基因體的召回率 (recall rate)，當讀長從 300 bp 增加至 4,000 bp 時，召回率...
MISEV 2018懶人包：明辨EVs MISEV 2018在EV characterization章節特別新增EV樣本的純度控制；汙染物的類型因提取來源而異，最常的有：血清、血漿來源的脂蛋白 (lipoprotein) 或尿液來源的Tamm-Horsfall protein或核酸碎片。另一方面，定義單顆完整EV亦是純度控制的重要項目之一，MISEV 2018提供數種方式： 單個EVs高分...
▋外泌體領域的新手、老手都必看圖爾思準備的MISEV 2018懶人包 “細胞外囊泡及其功能定義的最低實驗要求” (Minimal information for studies of extracellular vesicles) 是國際細胞外囊泡協會 (ISEV) 的共識倡議。 MISEV 的最後一次更新是 MISEV2018，得到了 400 多名科學家的意見，並在 EV 命名法、樣品收...
原創文章 引用請註明出處 ▌案件大綱 品項: Whole Genome Sequencing 定序平台: Oxford Nanopore Technologies PromethION 樣品物種/類型: 鳥類 DNA 欲解決案件難題: 案主希望進行鳥類基因體的發表，因此委託圖爾思進行三代定序，雖然準備的樣品 DNA 完整度很好，但是一開始定序產出不盡理想...
原創文章 引用請註明出處 ▌案件大綱 品項: 動物基因體定序 定序平台: Oxford Nanopore Technologies-PromethION 樣品物種/類型: 魚類/組織 欲解決案件難題: 案主有一基因轉殖斑馬魚，雖已知轉殖基因序列但不知道該序列插入的基因體位置，所以無法進行後續實驗驗證， 需要選擇合適的定序平台且進行客...
原創文章 引用請註明出處 ▌案件大綱 品項: 動物基因體定序 定序平台: PacBio Sequel IIe 樣品物種/類型: 魚類/組織 欲解決案件難題: 客戶欲定序手中的魚類物種，該物種已於 Illumina 定序平台與 Nanopore MinION 定序平台完成定序，但由於該魚類物種重複序列占比高達 30~40%，依靠既有的數據進行組裝...
單細胞定序技術雖然逐漸普及於不同的研究領域，但是對於細胞品質的高度要求，一定程度限制了樣品來源的類型以及上機時間地點，讓研究人員仍然有許多大膽的想法等待著被實踐，而甫於2022年推出的 Single Cell Fixed RNA Profiling Kit，能固定細胞當下的狀態並保存，不再受到樣品製備後須立刻上機的時間限制。 Figure 1 不...
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