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單細胞定序技術雖然逐漸普及於不同的研究領域，但是對於細胞品質的高度要求，一定程度限制了樣品來源的類型以及上機時間地點，讓研究人員仍然有許多大膽的想法等待著被實踐，而甫於2022年推出的 Single Cell Fixed RNA Profiling Kit (已更名為Single Cell Gene Expression Flex) ，能固定細胞當下的狀態並保存，不再受到樣...
原創文章 引用請註明出處 ▌案件大綱 品項: Whole Genome Sequencing / Iso-Seq 定序平台: PacBio Sequel IIe 樣品物種/類型: 昆蟲 DNA / RNA 欲解決案件難題: 客戶希望進行昆蟲基因體的發表，因此委託圖爾思進行三代定序和分析，但是在樣品製備步驟就卡關，準備的樣品一直無法通過品質檢驗。 解方: 經...
原創文章 引用請註明出處 ▌案件大綱 品項: Whole Genome Sequencing 定序平台: Oxford Nanopore Technologies PromethION 樣品物種/類型: DNA病毒 / 純化 gDNA 欲解決案件難題: 客戶曾經委託其它廠商進行 PacBio 病毒全基因體定序，發現組裝基因體大小與實驗預期不符，缺失資訊佔整個基因體高達 20%...
為回饋所有雲平台使用者，近期新增四項分析工具！只要你有雲平台帳號都可以免費、無限次數使用！ 圖爾思雲平台目前提供4大分析項目 RNAseq FL16S scRNA WES/WGS 除此之外，在左下角還有一個神秘的區域 『 Tools Box 』 集結了統計圖繪製、序列工具、PCA圖繪製等超實用功能！ 上傳數據輕鬆點，就能方便使用～ ...
PTM會影響蛋白的行為與特徵，包含結構、功能性、壽命、交互作用、分子傳遞、受體激活、折疊與定位等，對於細胞調控扮演著相當重要的關鍵。目前已經有超過400多種不同類型的PTM，。其中最常見的PTM修飾類型有，磷酸化(phosphorylation)、甲基化(methylation)、醣基化(glycosylation)、泛素化(ubiquitination)、乙醯化(N...
原創文章 引用請註明出處 你是否聽過 Nanopore 定序的蛋白通道活性非常不穩定? 你是否持續聽到身邊的人說 Nanopore 定序錯誤率好高高? 你是否聽到大家都說 Nanopore 的數據需要合併 Illumina 的數據進行校正才足夠準確? 但是， 你是否查證過這些消息是 Nanopore 定序剛進入定序市場的評價還是現今...
原創文章 引用請註明出處 ▌案件大綱 品項: FL16S rRNA gene 定序 定序平台: PacBio Sequel IIe 樣品物種/類型: 小鼠/糞便檢體 欲解決案件難題:客戶腸道菌主題研究計畫原先使用 16S v3-v4 定序進行，在聽完三代定序巡迴演講後想轉做全長 16S 以求較多的資訊進行投稿，但 16S v3-v4計畫仍在進行中。 ...
原創文章 引用請註明出處 今天這篇文章小編感覺是不小心收了 PacBio 紅包而寫的?! 開玩笑的啦~ 人家 PacBio 就真的有實力，我們只是據實以告而已。 本文以 2022 年 5 月發表在 Cell Genome的 FDA 真實挑戰賽 V2 為主軸[1]，跟大家分享 FDA 真實挑戰賽在做什麼，以及這次參賽選手們的表現如何~ 什麼是FDA真...
原創文章 引用請註明出處 長讀長的三代定序在總體基因體 (Metagenome) 研究上，到底有什麼優勢呢？ 在2020年的一篇文獻中，利用電腦模擬方式去比較二代定序以及三代定序技術去定序真核生物總體基因體。結果發現長讀長可以增加動植物基因體的召回率 (recall rate)，當讀長從 300 bp 增加至 4,000 bp 時，召回率...
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