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GBS(Genotyping-by-Sequencing)是一種常見的簡化基因體定序技術,其原理是將基因體DNA進行酶切,然後對酶切片段兩端序列進行高通量定序,透過分析獲得SNP資訊並進行基因分型,是一種快速、簡便、低成本的基因分型方法,適合對大規模樣品進行標記篩選。近年來,透過GBS技術進行高通量定序,發表的文章數量逐年攀升,其中不...
據估計,全球約有3.5億抑鬱症患者,其中光中國的抑鬱症患者就已接近1億,且發病率呈上升趨勢。在很長一段時間內,人們簡單地把抑鬱情緒的起因歸咎於抑鬱症患者的內心不夠強大,而忽略了對抑鬱症的治療,隨著因抑鬱症自殺人數的逐年增加,抑鬱症越來越受到人們的關注,研究人員也一直在致力於抑鬱症的研究,下面小編就帶大家...
自從美國總統歐巴馬提出精準醫療一詞後,與精準醫療相關的產業持續火熱,要實現個人化治療,首先要攻克即時監測診斷技術。之前小編分享過液態活檢、外泌體等相關診斷技術,今天繼續給大家分享最近火熱的液態活檢之ctDNA 技術! 定義 講解ctDNA之前,先了解一下cfDNA的定義,cfDNA(cell free DNA),是血漿中游離存在...
消化系統疾病中有一種慢性復發型的發炎性腸道疾病(Inflammatory bowel disease,IBD),主要包括克隆氏症(Crohn's disease,CD)和潰瘍性結腸炎(Ulcerative colitis,UC)。 根據調查顯示,IBD近年來在先進國家中的發病率逐年上升,其致病因素和發病機制尚未清楚了解,目前普遍認為是由於遺傳易感個體對腸道微生...
這次就跟大家聊一聊新技術在微生物研究中的應用。細細想來,新技術的應用,怎麼能少得了它—全長擴增子定序。 定序平台 先介紹一下定序平台,目前應用較廣的技術是 PacbioRS II 和 Nanopore,Nanopore 利用新型納米孔技術,依據檢測DNA序列通過納米孔時電流的變化判斷鹼基資訊,但由於納米材料穩定性、電流幅度...
原創文章 引用請註明出處 在微生物多樣性研究中,樣品的處理與儲存條件對於分析微生物菌群有著重要的影響,尤其是進行人類腸道菌群研究時的樣品採集,由於往往無法採樣後立即進行人類糞便樣本的凍存處理或立即實驗分析,因此糞便樣品的保存方式及條件對於研究是相當重要的議題。 對於處理與保存的時間與方法的...
原創文章 引用請註明出處 從事基因體研究的科學家都曾遇到一個同樣的問題:使用Excel處理基因列表的時候,常會因為Excel的自動格式改正功能而造成基因名稱的錯誤,這些錯誤皆由於Excel將某些基因名稱改為日期或數值格式,而往往研究人員在研究時或發表文章前因忽略Excel的自動轉換而導致錯誤 [1, 2]。 ...
我們來看一看三代定序目前的發展,其實了解定序發展動向,會讓我們對後續定序研究能有更好掌握性,比如成本、通量及技術優劣勢等,使未來研究有更好的選擇。 以PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies奈米孔單分子定序技術,還有 Direct Genomics的Helicos 技術,被稱之為第三代定序技術。三代定序最大的特點...
抗生素的大量使用,導致耐藥性菌株大規模增加,土壤、水體、人體、動植物等環境,都有大量新的抗藥菌株和耐藥基因被發現。對這些耐藥菌株和基因進行監測,分析耐藥基因動態,對於解析耐藥基因產生機制、防治抗藥菌株氾濫有著重要的意義。這其中最核心的內容就是耐藥基因資料庫,一個完備、精確、更新及時的資料庫,是耐...
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