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|| DEG差異基因分析 || 到底是這家的RNAseq服務吸引人，還是那家的RNAseq服務令人嚮往? 本集對決內容 -- 大眾 vs. 小眾 關鍵的步驟，需要眾多的支持 差異基因的統計方法這麼多種，這種方法好嗎? 有沒有更多差異結果的呈現方法呢? 不論是實驗設計，或是選擇分析方法前，總會查詢文獻，並選擇Citation次數...
原創文章 引用請註明出處 上一篇文章跟大家分享了三代定序龍頭 Oxford Nanopore Technology (ONT) 在 2021 年的 21 件重要小事，怎麼可以錯過同為三代定序的龍頭 Pacific Bioscience (PacBio) 在 2021 年的進展呢？咱們輸人不輸陣，趕緊來看看在過去一年中，PacBio 發生了哪些重要事情吧！ 本文主要架構取材 Pac...
|| QC 和 Mapping 不能簡單 || 到底是這家的RNAseq服務吸引人，還是那家的RNAseq服務令人嚮往? 本集對決內容 -- 嚴謹 vs. 簡單 好的開始是成功的一半 有好的數據品質，才能有好的分析結果！ 數據真的ＯＫ嗎？ QC真的不嫌少！ QC結果一堆數值好難懂 Mapping的方式有差嗎？ 你對品質控管真的安...
|| 從"頭"開始的細心 || 到底是這家的RNAseq服務吸引人，還是那家的RNAseq服務令人嚮往? 本集對決內容 -- 有跡可循 vs.無跡可尋 // 拿到RNAseq分析結果，是否會遇到以下情況? // 打開資料夾，看不懂檔案名稱 找不到需要的檔案位置 看不懂圖片/分析內容 才剛開始要閱讀數據就卡關碰瓷？！ 這家...
【單細胞定序 新知分享】DISCO- 整合型單細胞圖譜參考資料庫 DISCO (Deeply Integrated Single-Cell Omics data) 是甫於2022年初發表的單細胞數據資料庫，深度整合多個單細胞技術平台將近4593例樣品，累積超過一千八百萬顆細胞的研究數據，涵蓋將近107種的組織/細胞/類器官 (organoid)，其中也包含相當多來自COVID-19相關...
原創文章 引用請註明出處 各位捧油~新年快樂!! 過完了一個農曆年讓人真正感覺 2021 年已經離我們遠去，祝福大家 2022 年都能邁向更好的自己(●’◡’●) 本篇譯自 Oxford Nanopore 官網 [1]，統整了 2021 年 Nanopore 本身技術或其使用者取得的關鍵進展，相信有些進展會讓你感到激勵人心、有些進展會...
mRNA在新冠疫情中異軍突起，成為炙手可熱的治療開發方向，目前在臨床用途主要集中在傳染病的疫苗、取代蛋白質或DNA進行基因治療遺傳性疾病或癌症。然而開發mRNA作為一種治療手段也面臨著與任何藥物投遞相同的挑戰：穩定性與傳遞。 首先mRNA依然可能激發急性免疫反應，進而被清除，無法有效地發揮功能。雙鏈和單鏈RNA...
原創文章 引用請註明出處 在上個月的文章【平台大亂鬥：比較二代與三代平台之間的再現性、準確性和實用性 (上)】中，介紹不同平台之間定序人類基因體 RM8392 細胞株的結果，比較了數據品質、覆蓋率、錯誤配對率等指標性數值。在這篇文章中，將為大家介紹不同平台定序人類基因體後，分析單核苷酸變異、插入/缺失...
原創文章 引用請註明出處 各位，元旦快樂 ~ 接下來就讓我們期待過年的 9 天連假吧!! (超認真的真心話) 繼續 (下) 篇的內容吧! (下) 篇的內容包含 Nanopore 定序平台的介紹、不同應用需要的數據量建議、Nanopore 提供之總體基因體學研究相關分析軟體以及案例分享，內容豐富請盡早服用，避免向隅喔~ 前情提要在這...
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