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原創文章 引用請註明出處 左邊的~右邊的~各位看倌看過來! 今天這篇文章是落落長的CRISPR-Cas9應用在三代定序進行PCR-Free建庫的完結篇,(上)篇提到了Pacific Biosciences(PacBio)與Oxford Nanopore Technologies(ONT)不約而同推出了應用CRISPR-Cas9技術對目標區域直接剪切後再將定序的Adaptor選擇性的連接到目標...
原創文章 引用請註明出處 想像我們要拼一組拼圖,10片拼圖與100片拼圖的拼裝時間與所費心力,照常理來說,拼10片拼圖較輕鬆、出錯率較低。將三代定序長讀長的特性應用於基因體的組裝,就跟拼拼圖一樣,組裝起來較二代定序更為容易。除此之外,三代定序較二代定序更容易偵測結構變異、定序重複序列以及高G/C區域...
原創文章 引用請註明出處 各位觀眾~四張Ace!! 相信有慧根的讀者肯定已經猜到今天的主題ˊ_>ˋ 沒錯,今天我們就來聊聊怎麼樣從龐大基因體中找出你想要的目標Ace區段! 相信很多研究者在經過一開始的廣泛篩選後,到最後都會有一個鎖定的研究目標,在這個階段我們就可以使用目標區間定序(Target Sequencing)在只...
原創文章 引用請註明出處 隨著精準醫療多方的應用,基因體的研究對於人類疾病解密有著相當的幫助,使得我們更了解疾病的機轉、如何預防以及更有效的治療。基因體的變異可分為單核苷酸變異 (Single nucleotide variants)、拷貝數目變異 (Copy number variants),包含:複製 (Duplication)、缺失 (Deletion)、倒轉...
【三代定序 新知分享】Homopolish: 移除Nanopore定序系統性錯誤的好工具 第三代定序,其定序片段從原本二代定序的300-600 bp,增加到上百個Kb,又被稱為長讀長定序。三代定序的主要廠商之一Nanopore,因其定序原理,使得超長片段定序為主要特色。近期,更有定序片段長達4Mb,以及定出目前世上最大基因體-昆士蘭肺魚基因體...
【客戶文獻 作者導讀-腸道菌群調節COPD(慢性阻塞性肺病)發病機理_Gut (IF: 23.059)】 除了先前的簡單導讀外,更邀請長庚大學 賴信志老師團隊的 林稚容 博士,為這次的研究成果做更詳細的解說。 前往原文 文:長庚大學 林稚容 博士 慢性肺阻塞(chronic obstructive pulmonary disease)在全球具有很高的患病率,並導...
原創文章 引用請註明出處 雖然小編知道我們聰明的讀者早八百年前就知道Iso-Seq是什麼了(不知道的也要趕快點頭喔),但是,還是邀請各位一起讀完這篇關於Iso-Seq的完整介紹喔! 話不囉嗦,我們直接破題! 所謂Iso-Seq就是 isoform sequencing,也就是同源異構體定序,是RNA sequencing的一種。Iso-Seq是由目前三代定...
【客戶文獻發表-圖爾思生資團隊協助客戶發表最新微生物研究成果_Gut (IF: 23.059)】 前往原文 賀賀賀!圖爾思郭育倫博士與生物資訊、實驗團隊協助長庚大學賴信志老師研究團隊完成最新微生物相關研究——腸道菌群調節COPD(慢性阻塞性肺病)發病機理:戈氏副擬桿菌脂多醣的抗發炎作用,並發表於Gut期刊(Impac...
原創文章 引用請註明出處 16S 核糖體 RNA (16S ribosomal RNA, 16S rRNA) 為原核生物核醣體小次單元的重要組成,16S rRNA 序列包含保守區以及 9 個高度變異區,稱為 V1-V9。而這些高度變異區域是具有特異性的序列,可做為細菌系統發育和分類的依據。因此,16S rRNA 基因定序已被廣泛用於鑑定各個領域的細菌研究...
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