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原創文章 引用請註明出處 微生物體資料分析通常為了考慮定序深度的差異，豐度會標準化為比例關係(例如，相對豐度)。而這樣的組成型資料常造成統計上的偏差，為了能改善其統計效力也發展出相應的分析方法。在進行相對豐度於組間的差異分析中，除了採用累計求合標準化(cumulative-sum scaling, CSS)方法的 meta...
原創文章 引用請註明出處 進行微生物群落研究時，往往會需要檢測菌相與不同環境變量(因子)間的相關性，例如： 1. 微生物群落與生態環境變量間的相關性 2. 人體微生物與疾病病程發展的相關性 3. 不同藥物處理後，微生物組成與病情改善間的相關性 因此需要透過特定的環境因子關聯模型，分析特定因子或因子組合對...
藉由超音波看見體內腫瘤細胞的基因表現 為了解讀細胞的功能，生物學家改造基因，讓細胞在開啟某個目標基因表現時，會和一個播報基因同時表現，利用播報基因製造出可在細胞外被觀察到的蛋白，就能方便地判定該基因的表現情形。然而一般經常使用的播報基因，像是GFP這種螢光蛋白，存在著一個很大的限制，也就是發出的螢光...
原創文章 引用請註明出處 (Seurat Vignettes) 隨著定序技術以及微流體技術的發展，單細胞定序的技術也越來越純熟。實驗技術方面全力衝刺，當然在後端資料分析研究也不能落人後！今天小編要來跟大家介紹一個強大的單細胞分析R套件 – Seurat [1][2]。它有多厲害呢？嘿嘿，就讓我們繼續看下去。我們...
細胞為進行科學研究時常用的模型之一，往往是科學研究進入動物研究模式前的階段，細胞研究模型的建立相對動物模式來說也相對簡單與單純。圖爾思在這邊就為大家整理幾種常見的細胞研究模型的建立方式： 以下為常見細胞刺激實驗的條件設定原理，若針對每個研究主題或作用的細胞進行實驗時，還是要先行測試刺激物劑量的有效濃...
原創文章 引用請註明出處 (10x Genomics, Loupe Browser) 單細胞定序的研究發展至今已經十幾年了。從下面這張圖[1]顯示每年新發表的單細胞定序技術，可偵測到的細胞數目近乎指數成長，每一年與前一年相比都是10倍上升，這也揭示單細胞定序發展的潛力。今天要跟大家介紹一個由 10x Genomics 公司所開發的...
抗獨特型抗體（anti-idiotype antibody, anti-ID antibody）是一種能專一性結合於另一抗體之獨特型（idiotype）的抗體。一個抗體上存在著許多個獨特位（idiotope），所謂idiotope是抗體變異區中具專一性的抗原決定簇，有些idiotope就是該抗體和抗原位點（epitope）結合的互補位（paratope），有些則包括了paratope和變異區...
組織染色(IHC)除了可以使用抗體(antibody)進行特定位置的染色外，根據不同的需求仍有多項特殊染劑可以針對科學家的需求進行組織染色(IHC)，下面就為大家介紹一些常見的組織染色法(IHC)： Hematoxylin-Eosin stain 可以用來做組織學的辨別，hematoxylin可以把nucleus chromatin和cytoplasm chromatin 染成藍紫色，Eos...
細胞增殖(Cell Proliferation)檢測方法 在細胞生長和分化的研究中，無論要評估某種藥物對細胞的毒性或對癌細胞生長的抑制情形，還是要分析某個生長因子對細胞生長的影響，都可以使用細胞增殖分析（cell proliferation assay）進行檢測活細胞數或分裂細胞數的變化情形。 Cell proliferation assay主要可分...
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