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實驗做多了總會遇到新的挑戰需要嘗試,如同第一次遇到不會溶解的合成胜肽讓人十分困擾,這樣後續的實驗就做不下去了啊!其實遇到這樣的問題不用讓自己太崩潰,在自己之前的經驗跟解決問題的過程中,看到了一句話讓我非常的寬心: ”Selecting the best solvent may be a result of a ‘trial-and-error’ pr...
原創文章 引用請註明出處 雖然目前定序成本已大幅下滑,但樣本間設置多少重複樣本的問題,仍讓我們面臨超出經費預算的尷尬。那麼在有限的預算下想要盡可能提高手上定序資料的利用價值,我們究竟該選擇定序深度還是樣本數目呢? 小編找了三篇具代表性的高引用文章,來說明雖然定序深度對偵測差異基因很重要...
原創文章 引用請註明出處 近年研究發現,細菌與疾病、癌症的發生有密不可分的關聯性,尤其是大腸癌的發生、診斷、治療與腸道菌叢的研究,更是許多醫生及科研人員所關注的方向。例如香港中文大學的于君教授今年(2018)四月發表在Microbiome的研究,以多國收集來共526個總體基因體(metagenomics)樣品,鑑定出七種...
原創文章 引用請註明出處 人類腸道微生物組成受許多因素所影響,但宿主遺傳的相對貢獻仍難以釐清。雖然目前已知自身的微生物體與父母相類似,一般認為可能是遺傳影響了人體微生物的差異,亦即基因決定了體內微生物的生長,因此以往研究著重於基因如何影響腸道微生物,但事實上也與全家人居住在相同的環境與相仿...
原創文章 引用請註明出處 人類細胞圖譜計畫 (Human Cell Atlas) 1990年代,美國國立衛生研究院(NIH, National Institutes of Health)提出了人類基因體計畫(HGP, Human Genome Project),並在2003年完成了第一組的人類基因體定序,這個集合了多個不同的國家,超過20所學校及研究單位共同執行,並耗資了...
原創文章 引用請註明出處 2017年5月12日Elizabeth A. Witherden等人在『Using systems biology approaches to elucidate cause and effect in host–microbiome interactions』文章中闡述目前微生物體研究在技術、計算、生物資訊分析上的侷限,因此提出應以系統生物學進行研究以確定關鍵微生物...
原創文章 引用請註明出處 人類的總體基因數目大約是二萬五千個,和其他哺乳類動物相比,身為萬物之靈的人類基因數目並無特別之處。科學家們不斷地尋找人類之所以能成為地球上優勢智慧物種的原因,各種假說眾說紛紜,直到現今仍然沒有明確的定論。小編今天要探討的是人類的第二個基因體,也就是腸道中所有細菌的基...
原創文章 引用請註明出處 “腸道益生菌”, “腸道菌相的平衡” 可以說是近來最熱門的討論話題。目前,社會大眾漸漸了解腸道內細菌的種類、數量跟身體的免疫系統以及很多疾病的發生息息相關,但是除了這些之外,腸道本身的健康也是另一個不容忽視的環節。腸道內細胞每天都有大量的磨損...
原創文章 引用請註明出處 10x Genomics簡介 最近小編常在開玩笑10x Genomics的操作平台看起來就像是一台CD player,然而近年來10x Genomics ChromiumTM儼然成為在單細胞RNA定序上最炙手可熱的平台,短短兩年內,用該平台研究單細胞轉錄體已發表8篇高影響因子的文章,平均影響因子為23.9,其中包含了2篇Cell跟1篇...
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